DICOM znamená Digital Imaging and Communications v lékařství a je to mezinárodní otevřený obrazový formát pro manipulaci, ukládání, tisk a přenos informací v lékařských snímcích.
Lékařské snímky se používají při identifikaci a vyšetření fyzických zranění a nemocí pomocí postupů jako Rentgen, CT skenování atd.
Tento článek uvádí nejlepší bezplatné linuxové aplikace používané pro zpracování obrázků generovaných zařízeními DICOM.
1. Amide
Amide je multiplatformní nástroj GTK+ pro prohlížení, registraci a analýzu souborů objemových lékařských zobrazovacích dat. Využívá grafické uživatelské rozhraní s dlouhým seznamem funkcí včetně načítání více datových sad najednou, generování prolétávajících filmů jako souborů MPEG1, průvodce anizotropním filtrováním, nezávislé a hromadné stanovení prahových hodnot datových sad atd.
AMIDE – Medical Imaging Data Examiner
2. DicomBrowser
DicomBrowser je otevřený zdroj založený na Java DICOM metadata aplikace inspektor a modifikátor. Byl vyvinut Neuroinformatics Research Group Washingtonské univerzity, aby byl vynikající v dávkové anonymizaci.
Je multiplatformní, dokáže současně načíst tisíce obrázků a také obsahuje rozhraní příkazového řádku pro anonymizační skriptovací stroj.
DicomBrowser – Zobrazení a úprava metadat DICOM
3. 3DimViewer
3DimViewer je odlehčený 3D prohlížeč pro různé platformy pro datové sady DICOM napsané v C++. Jedná se o open source se sadou funkcí, která zahrnuje ortogonální a multiplanární XY, XZ a YZ pohledy, nastavitelné okno hustoty, import více datových sad DICOM, 3D vizualizaci CT a MRI skenů, povrchové modelování libovolné segmentované tkáně, 3D vykreslování povrchu, atd.
3DimViewer- 3D prohlížeč lékařského DICOM
4. dcm4che
Na rozdíl od ostatních titulů v tomto seznamu je dcm4che sada vysoce výkonných aplikací na bázi Java shromážděných pro zdravotnické podniky a je používán po celém světě výzkumníky a v open source i komerčních aplikacích.
dcm4che vám umožňuje uložit jakýkoli typ objektu DICOM ve standardních souborových systémech s plnou podporou modelu klient/server PACS, DICOM IOD, více platforem a několika integračních profilů IHE.
Jeho funkce zahrnují také webové GUI pro administrátory, integrovaný server HL7, který může mimo jiné pracovat s typy zpráv ADT, ORU a ORM.
DCM4Che – Sbírka aplikací pro IT zdravotnictví
5. XMedcon
XMedcon je sada nástrojů a knihovna pro konverzi lékařských snímků s otevřeným zdrojovým kódem vyvinutá především pro konverzi rekonstruovaných nukleárních lékařských snímků.
Můžete jej použít ke čtení nepodporovaných souborů bez komprese, načítání nezpracovaných binárních/ASCII obrazových polí, k tisku hodnot pixelů, k zápisu PNG pro desktopové aplikace a k extrahování/změně pořadí specifikovaných obrázků mimo jiné funkce .
XMedcon – Medical Image Conversion Toolkit
6. Aeskulap
Aeskulap je lékařský prohlížeč obrázků, který byl vytvořen jako open source alternativa ke komerčním DICOM prohlížečům a je založen na glademm, gtkmm a gconfmm.
Umí načíst sérii snímků DICOM pro kontrolu a může je také načíst z archivních uzlů (aka PACS) přes síť.
Aeskulap – DICOM Image Viewer
7. Mango
Mango znamená GUI pro analýzu více obrázků a to poskytuje nástroje pro analýzu obrazu spolu s pohodlným GUI pro navigaci.
Může být použit pro úpravy ROI, skládání obrázků, statistickou analýzu, vykreslování povrchu atd. Můžete také přizpůsobit filtry, tabulky barev, formáty souborů, pracovat s pluginy a analyzovat další formáty obrázků, jako je např. MINC, NEMA-DES, NIFTI a NIFTI2.
Mango – GUI analýzy více obrázků
8. 3D slicer
3D Slicer je funkčně bohatá multiplatformní integrovaná aplikace pro zpracování snímků, lékařskou obrazovou informatiku a 3D vizualizaci určená pro klinické výzkumníci, lékaři a počítačoví vědci.
Můžete použít 3D slicer pro sofistikované manuální úpravy, automatickou segmentaci, analýzu a vizualizaci zobrazovacích dat difúzního tenzoru, čtení a zápis DICOM obrázků a dalších formátů, dávkové zpracování pomocí EMSegment BatchMake e.t.c filtrace a mnoha dalších funkcí .
3D slicer – analýza obrazu a vědecká vizualizace
9. SMILI
SMILI (vyslovováno „smajlík“) je open source lehká a multiplatformní knihovna obsahující sadu tříd pro vytváření lékařské image. aplikace pro zpracování a vědeckou vizualizaci.
Vyznačuje se jednoduchým GUI a CLI se standardními algoritmy zpracování pro vyhlazování, prahování, maskování atd. obrázků a modelů.
SMILI – Simple Medical Imaging Library Interface
10. openDICOM.NET
openDICOM.NEt je projekt, který implementuje zcela nový přístup ke knihovnám DICOM. Je napsán v C a obsahuje opendicom-utils pro práci s datovými slovníky v různých formátech.
Mezi jeho funkce patří stromové zobrazení obsahu ACR-NEMA a DICOM, podpora exportu obrázků ACR-NEMA a DICOM do různých formátů obrázků, zobrazení obrázků s podporou jednoho a více snímků, cyklování snímků známé jako filmový režim, úplná data DICOM 2007 a slovníky UID atd.
openDICOM.NET
11. Kradview
Kradview je zobrazovací zařízení kompatibilní s NMR, DICOM a X-ray vytvořené pro platformy podobné Unixu. Jeho účelem je usnadnit vykreslování obrázků DICOM bez ohledu na jejich velikost a úroveň přiblížení.
Původně jej vyvinul David Santo Orcero jako součást svého doktorského projektu a byl aktualizován Davidem del Rio Medinou, aby měl lepší výkon při vykreslování.
Kradview – Prohlížeč rentgenových snímků
Máte nějaké zkušenosti s výše uvedeným softwarem? Nebo možná znáte další spolehlivé tituly, které můžeme přidat do našeho seznamu. V sekci níže můžete přidat své návrhy a dotazy.
A nezapomeňte tento článek sdílet všude, kde to bude užitečné.